Yuqori va past xavfli oshqozon osti bezi adenokarsinomasi bemorlarini aniqlash uchun yangi immunitetga bog'liq LncRNA asosidagi imzo yaratish | BMC Gastroenterologiya

Oshqozon osti bezi saratoni dunyodagi eng xavfli o'smalardan biri bo'lib, uning prognozi yomon. Shuning uchun, oshqozon osti bezi saratoni xavfi yuqori bo'lgan bemorlarni aniqlash va davolashni moslashtirish va ushbu bemorlarning prognozini yaxshilash uchun aniq bashorat modeli zarur.
Biz UCSC Xena ma'lumotlar bazasidan Saraton Genom Atlasi (TCGA) oshqozon osti bezi adenokarsinomasi (PAAD) RNK seqment ma'lumotlarini oldik, korrelyatsiya tahlili orqali immunitet bilan bog'liq lncRNAlarni (irlncRNA) aniqladik va TCGA va normal oshqozon osti bezi adenokarsinomasi to'qimalari o'rtasidagi farqlarni aniqladik. DEirlncRNA) TCGA va oshqozon osti bezi to'qimalarining genotip to'qima ifodasidan (GTEx). Prognostik imzo modellarini yaratish uchun qo'shimcha bir o'zgaruvchili va lasso regressiya tahlillari o'tkazildi. Keyin biz egri chiziq ostidagi maydonni hisobladik va yuqori va past xavfli oshqozon osti bezi adenokarsinomasi bo'lgan bemorlarni aniqlash uchun optimal chegara qiymatini aniqladik. Yuqori va past xavfli oshqozon osti bezi saratoni bo'lgan bemorlarda klinik xususiyatlarni, immun hujayralari infiltratsiyasini, immunosupressiv mikromuhitni va kimyoterapiyaga chidamlilikni taqqoslash.
Biz 20 ta DEirlncRNA juftligini aniqladik va bemorlarni optimal chegara qiymatiga ko'ra guruhladik. Biz prognostik imzo modelimiz PAAD bilan og'rigan bemorlarning prognozini bashorat qilishda sezilarli natijalarga ega ekanligini ko'rsatdik. ROC egri chizig'ining AUC qiymati 1 yillik prognoz uchun 0,905, 2 yillik prognoz uchun 0,942 va 3 yillik prognoz uchun 0,966 ni tashkil qiladi. Yuqori xavfli bemorlarda omon qolish darajasi pastroq va klinik xususiyatlar yomonroq edi. Shuningdek, biz yuqori xavfli bemorlarda immunitet pasayganligini va immunoterapiyaga qarshilik ko'rsatishi mumkinligini ko'rsatdik. Hisoblash bashorat qilish vositalariga asoslangan paklitaksel, sorafenib va ​​erlotinib kabi saratonga qarshi dorilarni baholash PAAD bilan og'rigan yuqori xavfli bemorlar uchun mos bo'lishi mumkin.
Umuman olganda, bizning tadqiqotimiz juftlashgan irlncRNA asosida yangi prognostik xavf modelini yaratdi, bu oshqozon osti bezi saratoni bilan og'rigan bemorlarda istiqbolli prognostik qiymatni ko'rsatdi. Bizning prognostik xavf modelimiz tibbiy davolanishga mos keladigan PAAD bilan og'rigan bemorlarni farqlashga yordam berishi mumkin.
Oshqozon osti bezi saratoni - bu besh yillik omon qolish darajasi past va yuqori darajaga ega bo'lgan xavfli o'sma. Tashxis qo'yilgan paytda bemorlarning aksariyati allaqachon rivojlangan bosqichlarda. COVID-19 epidemiyasi sharoitida shifokorlar va hamshiralar oshqozon osti bezi saratoni bilan og'rigan bemorlarni davolashda juda katta bosim ostida bo'lishadi va bemorlarning oilalari ham davolash to'g'risida qaror qabul qilishda ko'plab bosimlarga duch kelishadi [1, 2]. Neoadjuvant terapiya, jarrohlik rezektsiya, nur terapiyasi, kimyoterapiya, maqsadli molekulyar terapiya va immun nazorat nuqtasi ingibitorlari (ICI) kabi DOADlarni davolashda katta yutuqlarga erishilgan bo'lsa-da, bemorlarning atigi 9% tashxis qo'yilgandan keyin besh yil omon qoladi [3]. ], 4]. Oshqozon osti bezi adenokarsinomasining dastlabki belgilari atipik bo'lgani uchun, bemorlarga odatda rivojlangan bosqichda metastazlar tashxisi qo'yiladi [5]. Shuning uchun, ma'lum bir bemor uchun individual kompleks davolash nafaqat omon qolishni uzaytirish, balki hayot sifatini yaxshilash uchun ham barcha davolash usullarining afzalliklari va kamchiliklarini hisobga olishi kerak [6]. Shuning uchun, bemorning prognozini aniq baholash uchun samarali bashorat modeli zarur [7]. Shunday qilib, PAAD bilan og'rigan bemorlarning omon qolishi va hayot sifatini muvozanatlash uchun tegishli davolash usuli tanlanishi mumkin.
PAADning yomon prognozi asosan kimyoterapiya preparatlariga chidamlilik bilan bog'liq. So'nggi yillarda immunitet nazorat nuqtasi ingibitorlari qattiq o'smalarni davolashda keng qo'llanilmoqda [8]. Biroq, oshqozon osti bezi saratonida ICI dan foydalanish kamdan-kam hollarda muvaffaqiyatli bo'ladi [9]. Shuning uchun, ICI terapiyasidan foyda ko'rishi mumkin bo'lgan bemorlarni aniqlash muhimdir.
Uzoq kodlamaydigan RNK (lncRNA) - bu transkriptlari >200 nukleotidga ega bo'lgan kodlamaydigan RNK turi. LncRNAlar keng tarqalgan va inson transkriptomining taxminan 80% ni tashkil qiladi [10]. Ko'pgina ishlar shuni ko'rsatdiki, lncRNA asosidagi prognostik modellar bemorlarning prognozini samarali bashorat qila oladi [11, 12]. Masalan, ko'krak bezi saratonida prognostik imzolarni yaratish uchun 18 ta autofagiya bilan bog'liq lncRNA aniqlandi [13]. Gliomaning prognostik xususiyatlarini aniqlash uchun yana oltita immunitet bilan bog'liq lncRNA ishlatilgan [14].
Oshqozon osti bezi saratonida ba'zi tadqiqotlar bemorning prognozini bashorat qilish uchun lncRNA asosidagi imzolarni yaratdi. Oshqozon osti bezi adenokarsinomasida ROC egri chizig'i ostidagi maydon (AUC) atigi 0,742 va umumiy omon qolish (OS) 3 yil bo'lgan 3-lncRNA imzosi o'rnatildi [15]. Bundan tashqari, lncRNA ifoda qiymatlari turli genomlar, turli ma'lumotlar formatlari va turli bemorlarda farq qiladi va bashoratli modelning ishlashi beqaror. Shuning uchun biz aniqroq va barqaror bashoratli model yaratish uchun immunitet bilan bog'liq lncRNA (irlncRNA) imzolarini yaratish uchun yangi modellashtirish algoritmidan, juftlashtirish va iteratsiyadan foydalanamiz [8].
Normallashtirilgan RNK seqment ma'lumotlari (FPKM) va klinik oshqozon osti bezi saratoni TCGA va genotip to'qima ekspressiyasi (GTEx) ma'lumotlari UCSC XENA ma'lumotlar bazasidan (https://xenabrowser.net/datapages/) olindi. GTF fayllari Ensembl ma'lumotlar bazasidan (http://asia.ensembl.org) olindi va RNK seqmentidan lncRNA ekspressiya profillarini ajratib olish uchun ishlatildi. Biz immunitet bilan bog'liq genlarni ImmPort ma'lumotlar bazasidan (http://www.immport.org) yuklab oldik va korrelyatsiya tahlili yordamida immunitet bilan bog'liq lncRNAlarni (irlncRNAlar) aniqladik (p <0.001, r > 0.4). TCGA-PAAD kohortasida (|logFC| > 1 va FDR) <0.05) GEPIA2 ma'lumotlar bazasidan (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) olingan irlncRNAlar va differentsial ifodalangan lncRNAlarni kesish orqali differentsial ifodalangan irlncRNAlarni (DEirlncRNAlar) aniqlash.
Bu usul ilgari xabar qilingan edi [8]. Xususan, biz juftlashgan lncRNA A va lncRNA B ni almashtirish uchun X ni quramiz. lncRNA A ning ifoda qiymati lncRNA B ning ifoda qiymatidan yuqori bo'lganda, X 1 deb belgilanadi, aks holda X 0 deb belgilanadi. Shuning uchun biz 0 yoki – 1 matritsasini olishimiz mumkin. Matritsaning vertikal o'qi har bir namunani, gorizontal o'q esa 0 yoki 1 qiymatiga ega har bir DEirlncRNA juftligini ifodalaydi.
Prognostik DEirlncRNA juftliklarini skrining qilish uchun bir o'zgaruvchili regressiya tahlili va undan keyin Lasso regressiyasi qo'llanildi. Lasso regressiya tahlilida har bir ishga tushirishda 1000 ta tasodifiy stimul bilan 10 marta takrorlangan 10 marta o'zaro tasdiqlash (p <0,05) qo'llanildi. Har bir DEirlncRNA juftligining chastotasi 1000 tsiklda 100 martadan oshganda, prognostik xavf modelini yaratish uchun DEirlncRNA juftliklari tanlandi. Keyin biz PAAD bemorlarini yuqori va past xavf guruhlariga ajratish uchun optimal chegara qiymatini topish uchun AUC egri chizig'idan foydalandik. Har bir modelning AUC qiymati ham hisoblab chiqildi va egri chiziq sifatida chizildi. Agar egri chiziq maksimal AUC qiymatini ko'rsatuvchi eng yuqori nuqtaga yetsa, hisoblash jarayoni to'xtaydi va model eng yaxshi nomzod deb hisoblanadi. 1, 3 va 5 yillik ROC egri chizig'i modellari qurildi. Prognostik xavf modelining mustaqil bashorat qilish samaradorligini tekshirish uchun bir o'zgaruvchili va ko'p o'zgaruvchili regressiya tahlillari qo'llanildi.
Immun hujayralarining infiltratsiya tezligini o'rganish uchun yettita vositadan foydalaning, jumladan, XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS va CIBERSORT. Immun hujayralarining infiltratsiya ma'lumotlari TIMER2 ma'lumotlar bazasidan yuklab olindi (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3). Qurilgan modelning yuqori va past xavfli guruhlari orasidagi immunitetga infiltratsiya qiluvchi hujayralar tarkibidagi farq Wilcoxon imzolangan darajali testi yordamida tahlil qilindi, natijalar kvadrat grafikda ko'rsatilgan. Xavf ballari qiymatlari va immunitetga infiltratsiya qiluvchi hujayralar o'rtasidagi bog'liqlikni tahlil qilish uchun Spearman korrelyatsiyasi tahlili o'tkazildi. Olingan korrelyatsiya koeffitsienti lolipop sifatida ko'rsatilgan. Ahamiyatlilik chegarasi p < 0,05 ga o'rnatildi. Jarayon R paketi ggplot2 yordamida amalga oshirildi. Immun hujayralarining infiltratsiya tezligi bilan bog'liq model va gen ekspressiya darajalari o'rtasidagi bog'liqlikni o'rganish uchun biz ggstatsplot paketini va skripka grafikasini vizualizatsiya qildik.
Oshqozon osti bezi saratonini klinik davolash usullarini baholash uchun biz TCGA-PAAD kohortasida keng qo'llaniladigan kimyoterapiya preparatlarining IC50 ni hisobladik. Yuqori va past xavf guruhlari o'rtasidagi yarim inhibitiv konsentratsiyalardagi (IC50) farqlar Wilcoxon imzolangan darajali testi yordamida taqqoslandi va natijalar R da pRRothetic va ggplot2 yordamida hosil qilingan quti grafiklari sifatida ko'rsatildi. Barcha usullar tegishli ko'rsatmalar va normalarga mos keladi.
Tadqiqotimizning ish jarayoni 1-rasmda ko'rsatilgan. lncRNAlar va immunitet bilan bog'liq genlar o'rtasidagi korrelyatsiya tahlilidan foydalanib, biz p < 0,01 va r > 0,4 ​​ga ega 724 ta irlncRNA ni tanladik. Keyin biz GEPIA2 ning differentsial ifodalangan lncRNA larini tahlil qildik (2A-rasm). Jami 223 ta irlncRNA pankreatik adenokarsinoma va normal pankreatik to'qima (|logFC| > 1, FDR < 0,05) o'rtasida DEirlncRNA deb nomlangan differentsial ifodalangan.
Bashoratli xavf modellarini qurish. (A) Differentsial ifodalangan lncRNAlarning vulqon grafigi. (B) 20 ta DEirlncRNA juftligi uchun lasso koeffitsientlarining taqsimoti. (C) LASSO koeffitsienti taqsimotining qisman ehtimollik dispersiyasi. (D) 20 ta DEirlncRNA juftligining bir o'zgaruvchili regressiya tahlilini ko'rsatuvchi o'rmon grafigi.
Keyin biz 223 ta DEirlncRNA juftligini birlashtirish orqali 0 yoki 1 matritsasini yaratdik. Jami 13 687 ta DEirlncRNA juftligi aniqlandi. Bir o'zgaruvchili va lasso regressiya tahlilidan so'ng, prognostik xavf modelini yaratish uchun 20 ta DEirlncRNA juftligi nihoyat sinovdan o'tkazildi (2B-D-rasm). Lasso va ko'p regressiya tahlili natijalariga asoslanib, biz TCGA-PAAD kohortasidagi har bir bemor uchun xavf ballini hisobladik (1-jadval). Lasso regressiya tahlili natijalariga asoslanib, biz TCGA-PAAD kohortasidagi har bir bemor uchun xavf ballini hisobladik. ROC egri chizig'ining AUC qiymati 1 yillik xavf modeli bashorati uchun 0,905, 2 yillik bashorat uchun 0,942 va 3 yillik bashorat uchun 0,966 ni tashkil etdi (3A-B-rasm). Biz optimal chegara qiymatini 3.105 ga o'rnatdik, TCGA-PAAD kohortasi bemorlarini yuqori va past xavf guruhlariga ajratdik va har bir bemor uchun omon qolish natijalari va xavf ballari taqsimotini chizdik (3C-E-rasm). Kaplan-Meier tahlili shuni ko'rsatdiki, yuqori xavf guruhidagi PAAD bemorlarining omon qolish darajasi past xavf guruhidagi bemorlarnikiga qaraganda ancha past edi (p <0.001) (3F-rasm).
Prognostik xavf modellarining haqiqiyligi. (A) Prognostik xavf modelining ROCsi. (B) 1, 2 va 3 yillik ROC prognostik xavf modellari. (C) Prognostik xavf modelining ROCsi. Optimal chegara nuqtasini ko'rsatadi. (DE) Omon qolish holati (D) va xavf ballarining taqsimoti (E). (F) Yuqori va past xavf guruhlaridagi PAAD bemorlarining Kaplan-Meier tahlili.
Biz klinik xususiyatlar bo'yicha xavf ballaridagi farqlarni qo'shimcha ravishda baholadik. Chiziqli grafik (4A-rasm) klinik xususiyatlar va xavf ballari o'rtasidagi umumiy bog'liqlikni ko'rsatadi. Xususan, keksa bemorlarda xavf ballari yuqoriroq edi (4B-rasm). Bundan tashqari, II bosqichli bemorlarda I bosqichli bemorlarga qaraganda xavf ballari yuqoriroq edi (4C-rasm). PAAD bemorlarida o'sma darajasiga kelsak, 3-darajali bemorlarda xavf ballari 1 va 2-darajali bemorlarga qaraganda yuqoriroq edi (4D-rasm). Bundan tashqari, biz bir o'zgaruvchili va ko'p o'zgaruvchili regressiya tahlillarini o'tkazdik va xavf ballari (p < 0,001) va yosh (p = 0,045) PAAD bilan og'rigan bemorlarda mustaqil prognostik omillar ekanligini ko'rsatdik (5A-B-rasm). ROC egri chizig'i PAAD bilan og'rigan bemorlarning 1, 2 va 3 yillik omon qolishini bashorat qilishda xavf ballari boshqa klinik xususiyatlarga qaraganda ustun ekanligini ko'rsatdi (5C-E-rasm).
Prognostik xavf modellarining klinik xususiyatlari. Gistogramma (A) TCGA-PAAD kohortasidagi bemorlarning (B) yoshini, (C) o'sma bosqichini, (D) o'sma darajasini, xavf balini va jinsini ko'rsatadi. **p < 0.01
Prognostik xavf modellarining mustaqil bashoratli tahlili. (AB) Prognostik xavf modellari va klinik xususiyatlarining bir o'zgaruvchili (A) va ko'p o'zgaruvchili (B) regressiya tahlillari. (CE) Prognostik xavf modellari va klinik xususiyatlari uchun 1, 2 va 3 yillik ROC
Shuning uchun biz vaqt va xavf ballari o'rtasidagi bog'liqlikni tekshirdik. Biz PAAD bemorlarida xavf ballari CD8+ T hujayralari va NK hujayralari bilan teskari bog'liqligini aniqladik (6A-rasm), bu yuqori xavf guruhida immun funktsiyasining susayishini ko'rsatadi. Shuningdek, biz yuqori va past xavf guruhlari o'rtasida immun hujayralari infiltratsiyasidagi farqni baholadik va bir xil natijalarni topdik (7-rasm). Yuqori xavf guruhida CD8+ T hujayralari va NK hujayralarining infiltratsiyasi kamroq kuzatildi. So'nggi yillarda qattiq o'smalarni davolashda immun nazorat nuqtasi ingibitorlari (ICI) keng qo'llanilmoqda. Biroq, oshqozon osti bezi saratonida ICI dan foydalanish kamdan-kam hollarda muvaffaqiyatli bo'ldi. Shuning uchun biz yuqori va past xavf guruhlarida immun nazorat nuqtasi genlarining ifodasini baholadik. Biz CTLA-4 va CD161 (KLRB1) past xavf guruhida haddan tashqari ifodalanganligini aniqladik (6B-G-rasm), bu past xavf guruhidagi PAAD bemorlari ICI ga sezgir bo'lishi mumkinligini ko'rsatadi.
Prognostik xavf modeli va immun hujayra infiltratsiyasining korrelyatsiya tahlili. (A) Prognostik xavf modeli va immun hujayra infiltratsiyasi o'rtasidagi korrelyatsiya. (BG) Yuqori va past xavf guruhlarida gen ekspressiyasini ko'rsatadi. (HK) Yuqori va past xavf guruhlarida ma'lum saratonga qarshi dorilar uchun IC50 qiymatlari. *p < 0.05, **p < 0.01, ns = ahamiyatli emas
Biz TCGA-PAAD kohortasida xavf ballari va keng tarqalgan kimyoterapiya agentlari o'rtasidagi bog'liqlikni yanada baholadik. Biz oshqozon osti bezi saratonida keng qo'llaniladigan saratonga qarshi dorilarni qidirdik va yuqori va past xavf guruhlari o'rtasida ularning IC50 qiymatlaridagi farqlarni tahlil qildik. Natijalar shuni ko'rsatdiki, AZD.2281 (olaparib) ning IC50 qiymati yuqori xavf guruhida yuqoriroq edi, bu yuqori xavf guruhidagi PAAD bemorlari AZD.2281 davolashga chidamli bo'lishi mumkinligini ko'rsatadi (6H-rasm). Bundan tashqari, paklitaksel, sorafenib va ​​erlotinibning IC50 qiymatlari yuqori xavf guruhida pastroq edi (6I-K-rasm). Bundan tashqari, biz yuqori xavf guruhida IC50 qiymati yuqori bo'lgan 34 ta saratonga qarshi dori vositasini va yuqori xavf guruhida IC50 qiymati past bo'lgan 34 ta saratonga qarshi dori vositasini aniqladik (2-jadval).
lncRNA, mRNA va miRNA keng tarqalgan bo'lib, saraton rivojlanishida hal qiluvchi rol o'ynashini inkor etib bo'lmaydi. Bir nechta saraton turlarida umumiy omon qolishni bashorat qilishda mRNA yoki miRNA ning muhim rolini qo'llab-quvvatlovchi ko'plab dalillar mavjud. Shubhasiz, ko'plab prognostik xavf modellari ham lncRNA ga asoslangan. Masalan, Luo va boshqalar. Tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, LINC01094 PC proliferatsiyasi va metastazida muhim rol o'ynaydi va LINC01094 ning yuqori ifodalanishi oshqozon osti bezi saratoni bilan og'rigan bemorlarning omon qolishining yomonligini ko'rsatadi [16]. Lin va boshqalar tomonidan taqdim etilgan tadqiqot shuni ko'rsatdiki, lncRNA FLVCR1-AS1 ning past regulyatsiyasi oshqozon osti bezi saratoni bilan og'rigan bemorlarda yomon prognoz bilan bog'liq [17]. Biroq, immunitet bilan bog'liq lncRNA saraton kasalligi bilan og'rigan bemorlarning umumiy omon qolishini bashorat qilish nuqtai nazaridan nisbatan kam muhokama qilinadi. So'nggi paytlarda saraton kasalligi bilan og'rigan bemorlarning omon qolishini bashorat qilish va shu bilan davolash usullarini sozlash uchun prognostik xavf modellarini yaratishga katta e'tibor qaratildi [18, 19, 20]. Saraton kasalligining boshlanishi, rivojlanishi va kimyoterapiya kabi davolash usullariga javob berishda immun infiltratlarining muhim roli tobora ko'proq tan olinmoqda. Ko'plab tadqiqotlar o'sma infiltratsiya qiluvchi immun hujayralari sitotoksik kimyoterapiyaga javob berishda muhim rol o'ynashini tasdiqladi [21, 22, 23]. O'sma immunitet mikromuhiti o'sma bemorlarining omon qolishida muhim omil hisoblanadi [24, 25]. Immunoterapiya, ayniqsa ICI terapiyasi, qattiq o'smalarni davolashda keng qo'llaniladi [26]. Immunitet bilan bog'liq genlar prognostik xavf modellarini yaratish uchun keng qo'llaniladi. Masalan, Su va boshqalar. Immunitet bilan bog'liq prognostik xavf modeli tuxumdon saratoni bemorlarining prognozini bashorat qilish uchun oqsil kodlovchi genlarga asoslangan [27]. lncRNA kabi kodlamaydigan genlar ham prognostik xavf modellarini yaratish uchun mos keladi [28, 29, 30]. Luo va boshqalar to'rtta immunitet bilan bog'liq lncRNA ni sinab ko'rishdi va bachadon bo'yni saratoni xavfi uchun bashoratli modelni yaratdilar [31]. Xon va boshqalar. Jami 32 ta differentsial ifodalangan transkript aniqlandi va shunga asoslanib, 5 ta muhim transkriptga ega bashorat modeli yaratildi, bu buyrak transplantatsiyasidan keyin biopsiya bilan tasdiqlangan o'tkir rad etishni bashorat qilish uchun juda tavsiya etilgan vosita sifatida taklif qilindi [32].
Ushbu modellarning aksariyati gen ekspressiya darajalariga, oqsil kodlovchi genlarga yoki kodlamaydigan genlarga asoslangan. Biroq, bir xil gen turli genomlarda, ma'lumotlar formatlarida va turli bemorlarda turli xil ekspressiya qiymatlariga ega bo'lishi mumkin, bu esa bashoratli modellarda beqaror taxminlarga olib keladi. Ushbu tadqiqotda biz aniq ekspressiya qiymatlaridan mustaqil ravishda ikki juft lncRNA bilan oqilona model yaratdik.
Ushbu tadqiqotda biz immunitet bilan bog'liq genlar bilan korrelyatsiya tahlili orqali birinchi marta irlncRNA ni aniqladik. Biz differentsial ifodalangan lncRNA bilan gibridizatsiya orqali 223 ta DEirlncRNA ni skrining qildik. Ikkinchidan, biz nashr etilgan DEirlncRNA juftlashtirish usuliga [31] asoslangan 0 yoki 1 matritsasini yaratdik. Keyin prognostik DEirlncRNA juftliklarini aniqlash va bashoratli xavf modelini yaratish uchun bir o'zgaruvchili va lasso regressiya tahlillarini o'tkazdik. Biz PAAD bilan og'rigan bemorlarda xavf ballari va klinik xususiyatlar o'rtasidagi bog'liqlikni yanada tahlil qildik. Biz PAAD bemorlarida mustaqil prognostik omil sifatida bizning prognostik xavf modelimiz yuqori darajadagi bemorlarni past darajadagi bemorlardan va yuqori darajadagi bemorlarni past darajadagi bemorlardan samarali ravishda farqlashi mumkinligini aniqladik. Bundan tashqari, prognostik xavf modelining ROC egri chizig'ining AUC qiymatlari 1 yillik prognoz uchun 0,905, 2 yillik prognoz uchun 0,942 va 3 yillik prognoz uchun 0,966 ni tashkil etdi.
Tadqiqotchilar CD8+ T hujayralari infiltratsiyasi yuqori bo'lgan bemorlar ICI davolashga ko'proq sezgir bo'lganliklarini xabar qilishdi [33]. O'sma immun mikro muhitida sitotoksik hujayralar, CD56 NK hujayralari, NK hujayralari va CD8+ T hujayralari miqdorining ortishi o'smani bostiruvchi ta'sirning sabablaridan biri bo'lishi mumkin [34]. Avvalgi tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, o'sma infiltratsiyasi yuqori bo'lgan CD4(+) T va CD8(+) T darajalari uzoqroq umr ko'rish bilan sezilarli darajada bog'liq [35]. CD8 T hujayralarining yomon infiltratsiyasi, past neoantigen yuki va yuqori immunosupressiv o'sma mikro muhiti ICI terapiyasiga javob bermasligiga olib keladi [36]. Biz xavf ballari CD8+ T hujayralari va NK hujayralari bilan salbiy bog'liqligini aniqladik, bu esa yuqori xavf ballariga ega bemorlar ICI davolash uchun mos kelmasligi va yomonroq prognozga ega bo'lishi mumkinligini ko'rsatadi.
CD161 tabiiy qotil (NK) hujayralarining markeridir. CD8+CD161+ CAR tomonidan transduksiya qilingan T hujayralari HER2+ oshqozon osti bezi kanalining adenokarsinoma ksenograft modellarida in vivo antitumor samaradorligini oshiradi [37]. Immun nazorat nuqtasi ingibitorlari sitotoksik T limfotsitlari bilan bog'liq oqsil 4 (CTLA-4) va dasturlashtirilgan hujayra o'limi oqsili 1 (PD-1)/dasturlashtirilgan hujayra o'limi ligandi 1 (PD-L1) yo'llarini nishonga oladi va ko'plab sohalarda katta salohiyatga ega. CTLA-4 va CD161 (KLRB1) ning ifodalanishi yuqori xavf guruhlarida pastroq, bu esa yuqori xavf ballariga ega bemorlar ICI davolash uchun mos kelmasligi mumkinligini ko'rsatadi. [38]
Yuqori xavf ostidagi bemorlar uchun mos davolash usullarini topish uchun biz turli xil saratonga qarshi dorilarni tahlil qildik va PAAD bilan og'rigan bemorlarda keng qo'llaniladigan paklitaksel, sorafenib va ​​erlotinib PAAD bilan og'rigan yuqori xavf ostidagi bemorlar uchun mos bo'lishi mumkinligini aniqladik. [33]. Zhang va boshqalar har qanday DNK shikastlanishiga javob (DDR) yo'lidagi mutatsiyalar prostata saratoni bilan og'rigan bemorlarda yomon prognozga olib kelishi mumkinligini aniqladilar [39]. Oshqozon osti bezi saratoni Olaparib davom etayotgan (POLO) sinovi shuni ko'rsatdiki, olaparib bilan qo'llab-quvvatlovchi davolash oshqozon osti bezi kanal adenokarsinomasi va BRCA1/2 germinal mutatsiyalari bo'lgan bemorlarda birinchi qator platina asosidagi kimyoterapiyadan keyin platsebo bilan solishtirganda progressiyasiz omon qolishni uzaytirdi [40]. Bu bemorlarning ushbu kichik guruhida davolash natijalari sezilarli darajada yaxshilanishiga sezilarli optimizm beradi. Ushbu tadqiqotda AZD.2281 (olaparib) ning IC50 qiymati yuqori xavf guruhida yuqoriroq edi, bu yuqori xavf guruhidagi PAAD bemorlari AZD.2281 bilan davolanishga chidamli bo'lishi mumkinligini ko'rsatadi.
Ushbu tadqiqotdagi prognozlash modellari yaxshi prognozlash natijalarini beradi, ammo ular analitik prognozlarga asoslangan. Ushbu natijalarni klinik ma'lumotlar bilan qanday tasdiqlash muhim savol. Endoskopik ingichka igna aspiratsiya ultratovush tekshiruvi (EUS-FNA) 85% sezgirlik va 98% o'ziga xoslik bilan qattiq va ekstrapankreatik oshqozon osti bezi lezyonlarini tashxislash uchun ajralmas usulga aylandi [41]. EUS ingichka igna biopsiyasi (EUS-FNB) ignalarining paydo bo'lishi asosan FNAga nisbatan yuqori diagnostika aniqligi, gistologik tuzilishni saqlaydigan namunalarni olish va shu tariqa ma'lum tashxislar uchun muhim bo'lgan immun to'qimasini yaratish kabi afzalliklarga asoslangan. maxsus bo'yash [42]. Adabiyotlarni tizimli ravishda ko'rib chiqish FNB ignalari (ayniqsa 22G) oshqozon osti bezi massalaridan to'qimalarni yig'ishda eng yuqori samaradorlikni namoyish etishini tasdiqladi [43]. Klinik jihatdan, bemorlarning oz qismi radikal jarrohlik amaliyotiga mos keladi va ko'pchilik bemorlarda dastlabki tashxis qo'yilgan paytda operatsiya qilib bo'lmaydigan o'smalar mavjud. Klinik amaliyotda bemorlarning faqat oz qismi radikal jarrohlik amaliyotiga mos keladi, chunki ko'pchilik bemorlarda dastlabki tashxis qo'yilgan paytda operatsiya qilib bo'lmaydigan o'smalar mavjud. EUS-FNB va boshqa usullar bilan patologik tasdiqlangandan so'ng, odatda kimyoterapiya kabi standartlashtirilgan jarrohlik bo'lmagan davolash usuli tanlanadi. Bizning keyingi tadqiqot dasturimiz ushbu tadqiqotning prognostik modelini retrospektiv tahlil orqali jarrohlik va jarrohlik bo'lmagan kohortalarda sinab ko'rishdan iborat.
Umuman olganda, bizning tadqiqotimiz juftlashgan irlncRNA asosida yangi prognostik xavf modelini yaratdi, bu oshqozon osti bezi saratoni bilan og'rigan bemorlarda istiqbolli prognostik qiymatni ko'rsatdi. Bizning prognostik xavf modelimiz tibbiy davolanishga mos keladigan PAAD bilan og'rigan bemorlarni farqlashga yordam berishi mumkin.
Joriy tadqiqotda foydalanilgan va tahlil qilingan ma'lumotlar to'plamlari tegishli muallifdan oqilona so'rov bo'yicha olinishi mumkin.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. COVID-19 pandemiyasi davrida salbiy his-tuyg'ularni hissiy jihatdan tartibga solishda o'ziga ishonchning vositachilik roli: kesma tadqiqot. Int J Ment Health Nurs [jurnal maqolasi]. 2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J va boshqalar. Reanimatsiya bo'limlarida muqobil qarorlar qabul qilish bo'yicha oila a'zolarining qarashlari: tizimli tahlil. INT J NURS STUD [jurnal maqolasi; sharh]. 2023 01/01/2023;137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Oshqozon osti bezi saratoni. Lancet. [Jurnal maqolasi; tadqiqotni qo'llab-quvvatlash, NIH, sirtqi; tadqiqotni qo'llab-quvvatlash, AQShdan tashqaridagi hukumat; sharh]. 2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilich M, Ilich I. Oshqozon osti bezi saratonining epidemiologiyasi. Jahon gastroenterologiya jurnali. [Jurnal maqolasi, sharh]. 2016-yil 28-noyabr;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Oshqozon osti bezi saratoni bilan og'rigan bemorlarda umumiy omon qolishni bashorat qilish uchun yangi tp53 bilan bog'liq nomogramma. BMC Cancer [jurnal maqolasi]. 2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Kimyoterapiya olayotgan kolorektal saraton bemorlarida saraton bilan bog'liq charchoqqa yechimga yo'naltirilgan terapiyaning ta'siri: randomizatsiyalangan nazorat ostidagi sinov. Saraton hamshirasi. [Jurnal maqolasi; randomizatsiyalangan nazorat ostidagi sinov; tadqiqot Qo'shma Shtatlardan tashqaridagi hukumat tomonidan qo'llab-quvvatlanadi]. 2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y va boshqalar. Operatsiyadan keyingi karsinoembrion antigen (CEA) darajasi normal operatsiyadan oldingi CEA darajasiga ega bemorlarda kolorektal saraton rezektsiyasidan keyingi natijani bashorat qiladi. Translyatsion saraton tadqiqotlari markazi. [Jurnal maqolasi]. 2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X va boshqalar. Immunitet bilan bog'liq lncRNAlar yangi imzolarni yaratadi va inson gepatotsellyulyar karsinomasining immun landshaftini bashorat qiladi. Mol Ther Nuklein kislotalari [Jurnal maqolasi]. 2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Oshqozon osti bezi saratoni uchun immunoterapiya: to'siqlar va yutuqlar. Ann Gastrointestinal Surgeon [Jurnal maqolasi; sharh]. 2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. Uzoq kodlanmagan RNKlar (LncRNAlar), virusli o'sma genomikasi va g'ayritabiiy splaysing hodisalari: terapevtik oqibatlar. AM J CANCER RES [jurnal maqolasi; sharh]. 2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Endometrial saraton prognozi bilan bog'liq lncRNA imzolarini aniqlash. Fan yutuqlari [jurnal maqolasi]. 2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S va boshqalar. Papiller hujayrali buyrak hujayrali karsinomasida RNK bilan bog'lanadigan oqsil prognostik genlar va dori nomzodlarining kompleks tahlili. pregen. [Jurnal maqolasi]. 2021 01/20/2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X va boshqalar. Avtofagiya bilan bog'liq uzun kodlamaydigan RNKning xususiyatlari ko'krak bezi saratoni prognozini bashorat qiladi. pregen. [Jurnal maqolasi]. 2021 01/20/2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Immunitet bilan bog'liq oltita lncRNA imzosi glioblastoma multiforme kasalligida prognozni yaxshilaydi. MOL Neyrobiologiyasi. [Jurnal maqolasi]. 2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z va boshqalar. Yangi tri-lncRNA imzosi oshqozon osti bezi saratoni bilan og'rigan bemorlarning omon qolishini bashorat qiladi. ONKOL VAKILLARI. [Jurnal maqolasi]. 2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 LIN28B ifodasini va PI3K/AKT yo'lini gubkalangan miR-577 orqali tartibga solish orqali oshqozon osti bezi saratonining rivojlanishini rag'batlantiradi. Mol Therapeutics – Nuklein kislotalari. 2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L va boshqalar. lncRNA FLVCR1-AS1 va KLF10 o'rtasidagi ijobiy teskari aloqa PTEN/AKT yo'li orqali oshqozon osti bezi saratonining rivojlanishini inhibe qilishi mumkin. J EXP Clin Cancer Res. 2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Gepatotsellyulyar karsinomada umumiy omon qolishni bashorat qiluvchi o'n uchta genni aniqlash. Biosci Rep [jurnal maqolasi]. 2021 04/09/2021.


Nashr vaqti: 2023-yil 22-sentabr